羅氏 NimbleGen 新推出細胞遺傳學芯片 CGH ISCA Plus)

羅氏NimbleGen新推出針對細胞遺傳學的NimbleGen CGH ISCA Plus細胞遺傳學芯片。細胞遺傳學研究在發(fā)育異常及腫瘤研究中都占有重要地位，其主要研究內(nèi)容為染色體異?，F(xiàn)象，包括拷貝數(shù)改變(Copy Number Variation, CNV)以及雜合性丟失(Loss of Heterozygosity, LOH)。這款新產(chǎn)品擁有420萬個DNA探針，包含有檢測CNV的CGH探針以及檢測LOH的SNP探針，可同時亦高分辨率地檢測CNV及LOH。不需要任何實驗流程的改變，就可以完成同時兩種測試。

該款芯片包含了來自ISCA, OMIM, Decipher等多個遺傳性**數(shù)據(jù)庫，廣泛的細胞遺傳學研究內(nèi)容。

針對418種的**相關(guān)區(qū)域進行設(shè)計，包括ISCA, OMIM, Decipher數(shù)據(jù)庫的4200種基因：

■ 含有約50萬個CGH探針，CNV分辨率可達15-20Kb

■ 通過64000個snp探針檢測LOH，分辨率達到5Mb

■ 一張芯片可檢測多個樣本，降低實驗成本

在數(shù)據(jù)分析方面，該產(chǎn)品配有不同的設(shè)計文件，可以以不同CNV及LOH分辨率解讀芯片實驗結(jié)果，并參照ISCA數(shù)據(jù)庫進行分析，如ISCA 44k，ISCA 60K，ISCA 105K，ISCA 180K，可以根據(jù)研究需要進行選擇。芯片可使用Deva、Nexus Copy Number Analysis 軟件進行分析，按照不同設(shè)計文件進行數(shù)據(jù)儲存及處理，獲得圖形化的CNV、LOH分析結(jié)果，并可與Decipher, 、ISCA 等數(shù)據(jù)庫相連，生成細胞遺傳學報告。

該芯片實驗的優(yōu)勢在于快速、高分辨率地檢測全基因組水平的染色體異常情況。相比傳統(tǒng)的染色體分型、原位雜交方法，更加高效，同時還可為每個樣本選取合適的對照，如腫瘤組織樣本與正常組織樣本進行對比，出生缺陷兒童的樣本與其正常父母樣本進行直接比較。