上個(gè)月，Life Technologies和Illumina各自發(fā)布了一款新產(chǎn)品，旨在**內(nèi)完**類基因組測(cè)序。引起了行業(yè)內(nèi)的軒然**。然而，在上周召開的基因組生物學(xué)技術(shù)進(jìn)展年會(huì)(AGBT)上，英國(guó)Oxford Nanopore Technologies公司(簡(jiǎn)稱Oxford)宣布推出一款便攜式的基因組測(cè)序儀，約摸只有U盤大小，立即引起市場(chǎng)轟動(dòng)。
相信大家還對(duì)Oxford公司的納米孔測(cè)序平臺(tái)GridION念念不忘：該系統(tǒng)將使用帶有多個(gè)蛋白納米孔的陣列芯片來分析DNA、RNA和蛋白等。該陣列芯片放置在一次性的cartridge內(nèi)，cartridge隨后上樣到節(jié)點(diǎn)(node)內(nèi)。用戶可根據(jù)需要，連接若干個(gè)這樣的節(jié)點(diǎn)，組成一個(gè)可擴(kuò)展的測(cè)序平臺(tái)。
就在大家對(duì)這款儀器翹首盼望時(shí)，Oxford又宣布了一個(gè)爆炸性的消息，便攜式的測(cè)序系統(tǒng)MinION即將在下半年上市。這款儀器只有U盤大小，價(jià)格低于900美元。這兩款系統(tǒng)都有望帶來高達(dá)100 kb的讀長(zhǎng)，而原始錯(cuò)誤率大約在1%左右。
據(jù)Oxford介紹，GridION有望帶來15分鐘的人類基因組測(cè)序，而MinION則更是一個(gè)大轉(zhuǎn)折(game-changer)。Oxford的CEO Gordon Sanghera指出，即插即用的MinION將帶來DNA測(cè)序的更廣泛應(yīng)用，“這將允許非專業(yè)科學(xué)家提取DNA信息。您需要的只是一臺(tái)筆記本電腦和軟件?！辈贿^，MinION設(shè)備是一次性的，產(chǎn)量也不如GridION那么高。
除了大小，讓人驚異的還有讀長(zhǎng)。目前新一代測(cè)序技術(shù)的讀長(zhǎng)普遍在200-300 bp，羅氏454的平臺(tái)去年升級(jí)為1000 bp，第三代PacBio RS系統(tǒng)的讀長(zhǎng)達(dá)到3000 bp，當(dāng)時(shí)已視為重大飛躍。如今，Oxford的測(cè)序平臺(tái)將帶來100 kb的讀長(zhǎng)，有望解決很多目前無能為力的問題。
強(qiáng)大競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手的出現(xiàn)，讓本來就不平靜的測(cè)序市場(chǎng)再次掀起波瀾。各大測(cè)序公司的股價(jià)應(yīng)聲齊跌。Life Technologies跌6%，Illumina跌3%，PacBio跌5%，Complete Genomics跌3%。
然而，以上皆為Oxford公布的數(shù)據(jù)，目前尚未發(fā)表文章，也還沒有客戶試用過。因此，可能要等到早期試用客戶使用過，或有論文發(fā)布，才能真正確定該平臺(tái)的性能是否如此出色。
參考文章：
Oxford Nanopore To Sell Tiny DNA Sequencer
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