基因表達(dá)分析好幫手：iReport?

號(hào)稱(chēng)全球**的PCR 組合佳補(bǔ)充——Ingenuity? iReport? 正式與2012年進(jìn)入商業(yè)運(yùn)作，該工具僅售495美元，能讓用戶(hù)以快速度了解到他們實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中的意義，且使用簡(jiǎn)單方便，表現(xiàn)出色，是基因表達(dá)工作者的工作好幫手。

iReport 僅售495美元，只占整個(gè)實(shí)驗(yàn)成本的一小部分，但卻具有很大價(jià)值。研究人員只需將自己的數(shù)據(jù)上傳至 Ingenuity 網(wǎng)站，便可獲得一個(gè)交互式定制 iReport 的鏈接，這份 iReport 報(bào)告給出了差異表達(dá)基因以及受實(shí)驗(yàn)影響大的**、功能、生物過(guò)程和通路。研究人員可以輕松獲知實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的意義，并通過(guò)對(duì)基因進(jìn)行交互式探索、可視化和篩選，找出可用來(lái)進(jìn)行追蹤研究的基因。為結(jié)果提供支持的 Ingenuity? Knowledge Base 是一項(xiàng)由人工審查的數(shù)據(jù)庫(kù)，包含百萬(wàn)條取自經(jīng)同行評(píng)審的文獻(xiàn)和常用數(shù)據(jù)庫(kù)的生物及化學(xué)研究發(fā)現(xiàn)。iReport 使研究人員可以檢驗(yàn)支持性的文獻(xiàn)證據(jù)、做筆記、共享報(bào)告、導(dǎo)出圖像用于出版并在購(gòu)買(mǎi)前進(jìn)行免費(fèi)預(yù)覽。

俄勒岡州立大學(xué) (Oregon State University) 博士后 Sumit Punj 表示：“這款 Ingenuity iReport 工具十分出色，對(duì)全世界特定條件下基因表達(dá)的變化進(jìn)行了總結(jié)。對(duì)統(tǒng)計(jì)信息完善的結(jié)果做出清晰透徹的描述幫助我快速找出與細(xì)胞通路、過(guò)程和**有關(guān)的候選目的基因。直觀的設(shè)計(jì)和簡(jiǎn)單的教程讓像我這樣的新用戶(hù)可以快速掌握?qǐng)?bào)告的格式，并在幾分鐘之內(nèi)熟練瀏覽整個(gè)報(bào)告。iReport 縮短了我從微陣列實(shí)驗(yàn)中獲取生物學(xué)意義的過(guò)程?！?/p>

德克薩斯大學(xué)加爾維斯頓醫(yī)學(xué)分部 (University of Texas Medical Branch at Galveston) 生物化學(xué)和分子生物學(xué)助理教授、核心實(shí)驗(yàn)室主任 Russ Carmical 博士表示：“iReport 正在將結(jié)果反饋給我的客戶(hù)。一般客戶(hù)都沒(méi)有時(shí)間或相關(guān)知識(shí)背景來(lái)熟練掌握進(jìn)行基因表達(dá)分析所需的、市場(chǎng)上可以買(mǎi)到的軟件包。iReport 簡(jiǎn)化了整個(gè)分析過(guò)程，使我們能夠及時(shí)向客戶(hù)提供一個(gè)透徹且易于理解的報(bào)告?！?/p>

OvaGENE Oncology **科學(xué)官 William Ricketts 評(píng)論說(shuō)：“iReport 用起來(lái)很簡(jiǎn)單，也很直觀，讓我迅速掌握了數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義，不需要花時(shí)間來(lái)處理復(fù)雜的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。簡(jiǎn)而言之，iReport 幫助我看到了通常被統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)所掩蓋的生物學(xué)意義?！?/p>

Ingenuity iReport 針對(duì)一系列儀器平臺(tái)和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)進(jìn)行了優(yōu)化，包括微陣列、RNA-Seq、QPCR 和其它的組學(xué)平臺(tái)。iReport 可通過(guò)核心實(shí)驗(yàn)室或直接向 Ingenuity 購(gòu)買(mǎi)。有意購(gòu)買(mǎi) iReport 或了解詳情的研究人員請(qǐng)瀏覽 www.ingenuity.com/getireport/ 。

Ingenuity? Systems 簡(jiǎn)介

Ingenuity Systems 是面向生命科學(xué)研究人員、計(jì)算生物學(xué)家、生物信息科學(xué)家和生命科學(xué)行業(yè)供應(yīng)商提供信息解決方案和定制服務(wù)的**供應(yīng)商。垂詢(xún)?cè)斍椋?qǐng)?jiān)L問(wèn)：www.ingenuity.com 。

實(shí)時(shí) PCR Ingenuity iReport

2012年4月9日，Ingenuity Systems 和 Life Technologies Corporation 發(fā)布針對(duì) TaqMan? Gene Expression Assays 經(jīng)過(guò)優(yōu)化的實(shí)時(shí) PCR Ingenuity iReport。這個(gè)新解決方案是一個(gè)交互式報(bào)告，使分析不會(huì)局限于 Ct 或倍數(shù)變化，而是提供與基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)相關(guān)的生物信息的**、動(dòng)態(tài)觀點(diǎn)。

位于瑞典哥德堡的 TATAA Biocenter 的創(chuàng)始人 Mikael Kubista 博士研究了單細(xì)胞星形膠質(zhì)細(xì)胞中的基因表達(dá)?！霸谖覀兊难芯恐校覀儾捎昧颂厥獠呗詠?lái)分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)并根據(jù)qPCR(定量 PCR)測(cè)量的基因表達(dá)之間的關(guān)系確定了重要的基因集。將這些數(shù)據(jù)上傳到 iReport，我們就能立刻發(fā)現(xiàn)潛藏在我們統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中的生物學(xué)，并根據(jù)有關(guān)我們單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中涉及的差異表達(dá)路徑提出新的假設(shè)?！?/p>

與以往將實(shí)驗(yàn)處理結(jié)果的時(shí)間浪費(fèi)在人工檢索不同的是，iReport 能夠讓實(shí)驗(yàn)室工作人員在一刻鐘之內(nèi)輕松得到所需的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，Life公司的分析主管認(rèn)為這是行業(yè)內(nèi)表現(xiàn)優(yōu)異的PCR組合補(bǔ)充，而且其電子商務(wù)體驗(yàn)也會(huì)很棒。