Ion Proton? Sequencer
HiSeq 2500
測序市場的領(lǐng)頭羊Illumina公司將推出一款新的測序儀。這個名為HiSeq 2500的系統(tǒng)將讓研究人員和臨床醫(yī)生能夠在大約24小時(shí)內(nèi)完成整個基因組的測序，即“**一個基因組”。而在這個消息發(fā)布的幾小時(shí)之前，Illumina的老對手，Life Technologis公司也宣布推出了Ion Proton測序儀，旨在**內(nèi)完**類基因組的測序，耗資約為1000美元。
過去，獲得結(jié)果的時(shí)間還不夠快和數(shù)據(jù)分析，可謂進(jìn)入臨床的兩大瓶頸。對于研究人員來說能同**分析數(shù)據(jù)是測序儀進(jìn)入臨床的關(guān)鍵因素之一。新測序儀能在24小時(shí)內(nèi)完成整個基因組的測序，正好解決了這個問題。新一代測序技術(shù)不再是大型實(shí)驗(yàn)室的專享，一些過去想都無法想象的研究方法，如今已觸手可及--兩大巨頭在小型測序儀市場上的競爭再次打響，可謂功不可沒。那么，這次推出的兩款測序儀，同樣是**一個基因組，主要差別有哪些呢?
據(jù)Illumina公司的Flatley介紹，HiSeq 2500的價(jià)格將是74萬美元(美國報(bào)價(jià)，不適合)，也可從現(xiàn)有的HiSeq 2000升級，費(fèi)用是5萬美元。儀器采用兩種模式，既可在27小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生120 Gb，也可在標(biāo)準(zhǔn)的HiSeq運(yùn)行中產(chǎn)生600 Gb。HiSeq 2500顯然將延續(xù)和擴(kuò)大Illumina在**測序儀領(lǐng)域的**優(yōu)勢。
Life Tech的新儀器Ion Proton只需要15萬美元(2012年1月Life Tech網(wǎng)站新聞公布, 美國本土報(bào)價(jià)，不適合。有網(wǎng)友補(bǔ)充，15萬美金是主機(jī)不帶附屬設(shè)備的，全部買齊大概要40萬美金。)。雖然目前Life Tech還沒有提供詳細(xì)的數(shù)據(jù)，看來Ion Proton在主攻的個人型測序儀市場上將再度掀起熱潮，因?yàn)樵诿绹鳱IH可能削減經(jīng)費(fèi)的形勢下，Ion Proton的價(jià)格可能會吸引相當(dāng)一部分科學(xué)家。目前Ion PGM的通量從314芯片的幾十Mb到316芯片的幾百M(fèi)b，以及新上市的Ion 318芯片超過1GB。
Broad研究院基因組測序和分析項(xiàng)目的聯(lián)合主管，同時(shí)也是Ion Proton系統(tǒng)的早期用戶的Chad Nusbaum認(rèn)為：Ion Proton系統(tǒng)的價(jià)格將是主要賣點(diǎn)。他覺得或許(兩者)數(shù)據(jù)質(zhì)量會有點(diǎn)差別，但不會太多。Ion Proton系統(tǒng)的低價(jià)格會吸引不少粉絲。對于Illumina的新儀器，他認(rèn)為，速度快當(dāng)然很好，但成本也是個考慮因素。(以上信息來自福布斯)不過毫無疑問，在**測序儀市場已經(jīng)占盡先機(jī)的Illumina并不會輕易放棄平價(jià)測序儀市場，我們期待不久的將來，Illumina還會再宣布Miseq的升級。早買儀器能早出結(jié)果早發(fā)文章，晚點(diǎn)買呢，或許能買到更先進(jìn)的版本，但又怕等決定買時(shí)人家已經(jīng)發(fā)表文章了，公布距離真正發(fā)售還有點(diǎn)時(shí)間，大家還Hold不Hold得住呢?
自此，兩大測序巨頭的測序競賽再次升級。此前三家測序巨頭的競爭，使得測序儀讀取DNA數(shù)據(jù)的速度越來越快，速度提升之快已經(jīng)超越了有名的“摩爾法則”對微處理器加速的預(yù)測。**回合中，Illumina推出的Genome Analyzer，迅速占領(lǐng)了新一代測序的市場，先撥頭籌。相比之下ABI推出的SOLiD雖然性能強(qiáng)大，可惜在單機(jī)高達(dá)50萬美元起步的**測序儀市場，還是稍晚了一步。ABI的轉(zhuǎn)機(jī)出現(xiàn)在2010年，不過當(dāng)時(shí)已不再是ABI，而是合并之后的Life Technologies。這年初，Ion Torrent公司一鳴驚人，推出了一款廉價(jià)小巧的半導(dǎo)體測序儀。Ion Torrent的創(chuàng)始人是Jonathan M. Rothberg，這個測序領(lǐng)域的傳奇人物在2000-2007年間創(chuàng)立的454 公司推出了**臺新一代測序儀，被羅氏收購。2007年-2010年他成立Ion Torrent公司，幾個月后，這家公司被Life Tech收購，Rothberg 成為Life Tech公司半導(dǎo)體測序部門的領(lǐng)頭人。Ion PGM雖不是**個上市的個人型測序儀，但因價(jià)格低廉、表現(xiàn)出色，獲得了很好的市場反應(yīng)，相比50萬美元以上級別的超豪華設(shè)備，5-10萬美元級別的Ion PGM更容易為普通實(shí)驗(yàn)室接受，無怪迅速成為當(dāng)年賣的快的測序儀。Illumina隨即推出價(jià)格在10萬美元級別的個人型測序儀MiSeq。
短短五年的時(shí)間，個人基因組測序費(fèi)用已降低了1000倍。測序技術(shù)發(fā)展之快，令人驚嘆。
**一個基因組，聽上去很美，但也對數(shù)據(jù)分析提出了更高的挑戰(zhàn)。**一個，分析得過來么?費(fèi)用如何?之前有專家預(yù)測，盡管千元基因組目標(biāo)的實(shí)現(xiàn)指日可待，但對于測序后的數(shù)據(jù)分析，則可能還要再加兩個零。測序儀的不斷升級也意味著，另一個數(shù)據(jù)分析市場的大門敞開了。學(xué)生物的將來不學(xué)生物信息學(xué)恐怕不行了!有網(wǎng)友打趣，也許再過十年去面試的時(shí)候，電子簡歷后面還要附上自己的全基因組序列。
