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日開發(fā)新軟件可追溯細(xì)胞的起源

追蹤一個(gè)細(xì)胞的活動(dòng)極其重要,近日日本福井大學(xué)沖昌也、吉田俊之等教授領(lǐng)導(dǎo)的研究小組開發(fā)出一種新軟件,可在計(jì)算機(jī)畫面上直觀個(gè)體細(xì)胞分裂、增殖的全過程,由此可追溯細(xì)胞的起源,該軟件的開發(fā)成功可進(jìn)一步促進(jìn)再生醫(yī)療的研究。

專家稱,該軟件能夠追蹤從本人開始今后十五代子孫后的細(xì)胞,更新了至今僅能追蹤到第四代細(xì)胞的歷史。目前在ips細(xì)胞(萬(wàn)能細(xì)胞)、胚胎干細(xì)胞(ES細(xì)胞)等用于再生醫(yī)療領(lǐng)域中,有必要納入表觀基因思路。

研究人員將可視綠色熒光蛋白質(zhì)(GFP)的酵母撒在培養(yǎng)盤里,經(jīng)電荷耦合器件攝像機(jī)(CCD)每隔兩分鐘攝像發(fā)現(xiàn),自同親緣細(xì)胞分裂出的子細(xì)胞呈相同色,由此可追溯細(xì)胞的起源,同時(shí)還可分析在各種環(huán)境下細(xì)胞的變化過程。

至今分析軟件識(shí)別細(xì)胞準(zhǔn)確率僅達(dá)60%左右,誤差較大,在系統(tǒng)未能識(shí)別情況下,還需人工錄入數(shù)據(jù),而新軟件可以做到全自動(dòng)化分析,精度也大幅度提高。此外,新軟件引用了表觀基因概念,即:據(jù)環(huán)境變化,特殊分子結(jié)合成DNA等時(shí)基因活動(dòng)會(huì)發(fā)生變化,即便是相同基因,細(xì)胞內(nèi)生成的蛋白質(zhì)可能不同。

新軟件還改變了傳統(tǒng)分析方法,以前為了看清每個(gè)細(xì)胞而數(shù)數(shù),分析一個(gè)24小時(shí)時(shí)段的圖像數(shù)據(jù)需要1周時(shí)間,采用新軟件后,分析時(shí)間縮短為2個(gè)小時(shí)左右。

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