羅氏454推出emPCR自動(dòng)化富集新方案

近，新的羅氏454測(cè)序emPCR自動(dòng)化富集方案出臺(tái)：利用羅氏的REM e移液系統(tǒng)，一次實(shí)驗(yàn)可以處理多達(dá)八個(gè)樣本的乳液PCR產(chǎn)物磁珠法富集，并完成測(cè)序引物退火，直接銜接在羅氏454 GS FLX進(jìn)行測(cè)序?qū)嶒?yàn)。這一方法可一步完成了多個(gè)富集步驟，減少人為操作引起的誤差，使得實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定，并大大縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間。該方案已成功地在Hamilton MICROLAB STARlet自動(dòng)化移液平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)。

454測(cè)序需要對(duì)制備的文庫(kù)進(jìn)行乳液PCR，對(duì)包含單克隆序列的測(cè)序珠進(jìn)行擴(kuò)增，其后需要分解該乳液體系，并對(duì)體系中的測(cè)序珠進(jìn)行洗滌以及富集。在洗滌及富集過程中，需要進(jìn)行反復(fù)的移液、離心、顛倒試管、磁力吸附等操作。

這一自動(dòng)化解決方案即替代了這一人工操作過程，只需少量的設(shè)置程序以及放置試管試劑的步驟就可以在無(wú)人情況下完成所有步驟，節(jié)省約五個(gè)小時(shí)左右的人工操作。單次自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)也只需3.5小時(shí)左右。

現(xiàn)在一共有五種不同的自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，配合不同的樣本數(shù)量及體積。

在Hamilton STARlet自動(dòng)化移液臺(tái)上，可以準(zhǔn)確設(shè)定羅氏REM e系統(tǒng)位置，以及其配套試管架的位置。實(shí)驗(yàn)所需放置的試管及試劑的種類和數(shù)量也在新的實(shí)驗(yàn)手冊(cè)中進(jìn)行了詳細(xì)描述。

羅氏的REM e系統(tǒng)可以進(jìn)行震蕩、真空抽濾、磁珠捕獲及加熱等實(shí)驗(yàn)操作。Hamilton STARlet移液平臺(tái)通過1000微升的獨(dú)立移液系統(tǒng)移動(dòng)液體。

羅氏的REM e系統(tǒng)也可以裝載在其他移液平臺(tái)上如Biomek及Tecan系列平臺(tái)等。

羅氏454公司將進(jìn)一步與該自動(dòng)化移液平臺(tái)公司合作開發(fā)配合GS Junior系統(tǒng)的自動(dòng)化解決方案， 可在Hamilton的STAR系列及NIMBUS系列自動(dòng)化移液平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)。小型的NIMBUS工作站與GS Junior臺(tái)式測(cè)序儀結(jié)合，使得測(cè)序總量較小的客戶能夠獲得完整而低資金投入的自動(dòng)化解決方案。